結局、、

regeditを実行して、自分で直接"DefaultReceiveWindow"と"DefaultSendWindow"に
今まで使ってた値を10進で入力、無事元の速度が出るようになりました。
まぁ計測サイトの速度なんて、自己満足みたいなものかもしれませんがね^^;
でもなんでツールを使った変更が適用されなかったのか、自分には知識不足で
よくわかりませんわ。